MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 3340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187081	CGC	2	6	48	53	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
2	NT_187081	GCT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
3	NT_187081	CTG	2	6	119	124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
4	NT_187081	CGGCG	2	10	127	136	0 %	0 %	60 %	40 %	409249207
5	NT_187081	ACT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249207
6	NT_187081	GGC	3	9	217	225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
7	NT_187081	CAT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249207
8	NT_187081	CGG	2	6	238	243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
9	NT_187081	GCT	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
10	NT_187081	GGC	2	6	313	318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
11	NT_187081	GCC	2	6	352	357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
12	NT_187081	GC	4	8	364	371	0 %	0 %	50 %	50 %	409249207
13	NT_187081	GGT	2	6	448	453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
14	NT_187081	TAC	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249207
15	NT_187081	TGG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
16	NT_187081	CTG	3	9	473	481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
17	NT_187081	CGC	2	6	487	492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
18	NT_187081	GCT	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
19	NT_187081	GCG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
20	NT_187081	TGG	2	6	543	548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
21	NT_187081	TGG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
22	NT_187081	CTG	3	9	668	676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
23	NT_187081	CGG	2	6	702	707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
24	NT_187081	TGA	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249207
25	NT_187081	CGG	2	6	774	779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
26	NT_187081	CGG	2	6	786	791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
27	NT_187081	GGC	2	6	799	804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
28	NT_187081	CTG	2	6	851	856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
29	NT_187081	GCC	2	6	905	910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
30	NT_187081	GCA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187081	TGA	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249208
32	NT_187081	AAC	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249208
33	NT_187081	CTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
34	NT_187081	GTT	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249208
35	NT_187081	GGC	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249208
36	NT_187081	GCT	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
37	NT_187081	GCA	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249208
38	NT_187081	GTC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
39	NT_187081	CAGT	2	8	1372	1379	25 %	25 %	25 %	25 %	409249208
40	NT_187081	TGGCA	2	10	1387	1396	20 %	20 %	40 %	20 %	409249208
41	NT_187081	GCA	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249208
42	NT_187081	CGG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249208
43	NT_187081	CTGC	2	8	1495	1502	0 %	25 %	25 %	50 %	409249208
44	NT_187081	CTG	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
45	NT_187081	CTG	2	6	1520	1525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
46	NT_187081	GCA	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249208
47	NT_187081	GCT	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
48	NT_187081	GCG	2	6	1584	1589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249208
49	NT_187081	GAT	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249208
50	NT_187081	CTG	2	6	1676	1681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
51	NT_187081	CTGA	2	8	1728	1735	25 %	25 %	25 %	25 %	409249208
52	NT_187081	CTG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187081	T	7	7	1916	1922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187081	CCAG	2	8	1938	1945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NT_187081	GGA	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187081	TATT	2	8	1999	2006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187081	ATAA	2	8	2047	2054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187081	AT	3	6	2055	2060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187081	AAT	2	6	2066	2071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187081	TAA	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187081	GAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249209
62	NT_187081	TGG	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
63	NT_187081	TGG	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
64	NT_187081	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249209
65	NT_187081	GCGCT	2	10	2491	2500	0 %	20 %	40 %	40 %	409249209
66	NT_187081	GCC	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249209
67	NT_187081	CGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249209
68	NT_187081	GTG	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
69	NT_187081	TGA	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249209
70	NT_187081	CG	3	6	2757	2762	0 %	0 %	50 %	50 %	409249209
71	NT_187081	GTG	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
72	NT_187081	T	6	6	2809	2814	0 %	100 %	0 %	0 %	409249209
73	NT_187081	AG	3	6	2861	2866	50 %	0 %	50 %	0 %	409249209
74	NT_187081	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249209
75	NT_187081	CTG	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249209
76	NT_187081	TTG	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249209
77	NT_187081	TCG	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249209
78	NT_187081	GCG	2	6	3084	3089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249209
79	NT_187081	CG	3	6	3276	3281	0 %	0 %	50 %	50 %	409249210
80	NT_187081	TAC	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249210
81	NT_187081	GCT	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249210
82	NT_187081	GGC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249210
83	NT_187081	CGG	2	6	3607	3612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249210
84	NT_187081	TCG	2	6	3649	3654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249210
85	NT_187081	GC	3	6	3687	3692	0 %	0 %	50 %	50 %	409249210
86	NT_187081	GCG	2	6	3846	3851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249210
87	NT_187081	GGT	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249210
88	NT_187081	GCGCT	2	10	3987	3996	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NT_187081	TCG	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249211
90	NT_187081	GCG	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249211
91	NT_187081	TCA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249211
92	NT_187081	CGG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249211
93	NT_187081	CTT	3	9	4669	4677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249211
94	NT_187081	GCT	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249211
95	NT_187081	CAT	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249211
96	NT_187081	ATA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187081	GGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187081	GTG	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187081	CTC	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249212
100	NT_187081	GAT	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249212
101	NT_187081	GCA	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249212
102	NT_187081	GGT	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249212
103	NT_187081	CAT	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249212
104	NT_187081	GCC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249212
105	NT_187081	TGGT	2	8	5554	5561	0 %	50 %	50 %	0 %	409249212
106	NT_187081	TCA	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249212
107	NT_187081	AAT	2	6	5698	5703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249212
108	NT_187081	GCG	2	6	5736	5741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249212
109	NT_187081	CCG	2	6	5761	5766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249212
110	NT_187081	AGA	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249212
111	NT_187081	ACC	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249212
112	NT_187081	CATA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	409249213
113	NT_187081	ACA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249213
114	NT_187081	GCC	2	6	6206	6211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
115	NT_187081	GCC	3	9	6215	6223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
116	NT_187081	CGC	2	6	6235	6240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
117	NT_187081	ATC	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249213
118	NT_187081	GC	3	6	6376	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
119	NT_187081	GC	3	6	6398	6403	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
120	NT_187081	GCT	2	6	6502	6507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
121	NT_187081	GAA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249213
122	NT_187081	CGG	2	6	6540	6545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249213
123	NT_187081	TAT	2	6	6547	6552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249213
124	NT_187081	CCA	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249213
125	NT_187081	TGA	2	6	6589	6594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249213
126	NT_187081	CAC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249213
127	NT_187081	CAAT	2	8	6648	6655	50 %	25 %	0 %	25 %	409249213
128	NT_187081	T	6	6	6671	6676	0 %	100 %	0 %	0 %	409249213
129	NT_187081	GC	3	6	6763	6768	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
130	NT_187081	GCT	2	6	6790	6795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
131	NT_187081	GGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249213
132	NT_187081	TGA	2	6	6868	6873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249213
133	NT_187081	CGC	2	6	6883	6888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
134	NT_187081	GTT	2	6	6896	6901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249213
135	NT_187081	CGC	2	6	6925	6930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
136	NT_187081	CTG	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
137	NT_187081	CGG	2	6	7012	7017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249213
138	NT_187081	GTACG	2	10	7027	7036	20 %	20 %	40 %	20 %	409249213
139	NT_187081	TCG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
140	NT_187081	CG	3	6	7042	7047	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
141	NT_187081	CAT	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249213
142	NT_187081	GTGG	2	8	7157	7164	0 %	25 %	75 %	0 %	409249213
143	NT_187081	GC	4	8	7192	7199	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
144	NT_187081	CG	3	6	7258	7263	0 %	0 %	50 %	50 %	409249214
145	NT_187081	ACGG	2	8	7339	7346	25 %	0 %	50 %	25 %	409249214
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149	NT_187081	GC	3	6	7419	7424	0 %	0 %	50 %	50 %	409249214
150	NT_187081	GGAA	2	8	7446	7453	50 %	0 %	50 %	0 %	409249214
151	NT_187081	CGCCAG	2	12	7495	7506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249214
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153	NT_187081	GCT	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249214
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157	NT_187081	CCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249214
158	NT_187081	GCT	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249214
159	NT_187081	ATGCGG	2	12	7771	7782	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249214
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161	NT_187081	CGG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249214
162	NT_187081	CG	4	8	7959	7966	0 %	0 %	50 %	50 %	409249214
163	NT_187081	CA	3	6	8103	8108	50 %	0 %	0 %	50 %	409249214
164	NT_187081	GCA	2	6	8133	8138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249214
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167	NT_187081	AAC	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NT_187081	TGCCAG	2	12	8310	8321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409249215
169	NT_187081	TAAT	2	8	8439	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	409249215
170	NT_187081	ACG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249215
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172	NT_187081	GCGA	2	8	8649	8656	25 %	0 %	50 %	25 %	409249215
173	NT_187081	CGA	2	6	8661	8666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249215
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176	NT_187081	GCA	2	6	8770	8775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249215
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179	NT_187081	GGA	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249215
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181	NT_187081	GTT	2	6	8996	9001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249215
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186	NT_187081	TATGG	2	10	9314	9323	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
187	NT_187081	TAA	2	6	9364	9369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NT_187081	ATC	2	6	9431	9436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NT_187081	A	7	7	9467	9473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NT_187081	ACGG	2	8	9499	9506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NT_187081	T	6	6	9524	9529	0 %	100 %	0 %	0 %	409249216
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196	NT_187081	GCG	2	6	9663	9668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249216
197	NT_187081	AGCGT	2	10	9710	9719	20 %	20 %	40 %	20 %	409249216
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217	NT_187081	TTA	3	9	10530	10538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NT_187081	ATA	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NT_187081	ATT	2	6	10600	10605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249217
222	NT_187081	CAGG	2	8	10670	10677	25 %	0 %	50 %	25 %	409249217
223	NT_187081	ATG	2	6	10690	10695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249217
224	NT_187081	CAG	2	6	10705	10710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249217
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241	NT_187081	CGCT	2	8	11366	11373	0 %	25 %	25 %	50 %	409249217
242	NT_187081	GTC	2	6	11414	11419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249217
243	NT_187081	TCA	2	6	11483	11488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249217
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245	NT_187081	TCA	2	6	11591	11596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249217
246	NT_187081	TAA	2	6	11602	11607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249217
247	NT_187081	CAG	2	6	11635	11640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249217
248	NT_187081	CTG	2	6	11707	11712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249217
249	NT_187081	AAT	2	6	11755	11760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249217
250	NT_187081	TTA	2	6	11813	11818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249217
251	NT_187081	TAA	2	6	11905	11910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249217
252	NT_187081	CGCC	2	8	11919	11926	0 %	0 %	25 %	75 %	409249217
253	NT_187081	GC	3	6	11928	11933	0 %	0 %	50 %	50 %	409249217
254	NT_187081	T	6	6	12084	12089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NT_187081	ATGA	2	8	12096	12103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
256	NT_187081	AAT	2	6	12155	12160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249218
257	NT_187081	CCTT	2	8	12198	12205	0 %	50 %	0 %	50 %	409249218
258	NT_187081	GGC	2	6	12212	12217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249218
259	NT_187081	CCGCG	2	10	12286	12295	0 %	0 %	40 %	60 %	409249218
260	NT_187081	GCG	2	6	12333	12338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249218
261	NT_187081	CG	3	6	12337	12342	0 %	0 %	50 %	50 %	409249218
262	NT_187081	CTT	2	6	12397	12402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249218
263	NT_187081	CTC	2	6	12407	12412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249218
264	NT_187081	CGC	2	6	12427	12432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249218
265	NT_187081	CAG	2	6	12476	12481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249218
266	NT_187081	GATCGC	2	12	12505	12516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409249218
267	NT_187081	CAG	2	6	12584	12589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249218
268	NT_187081	TCG	2	6	12612	12617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249218
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